MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 34052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014002	ATT	2	6	152520	152525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494810
2502	NC_014002	CAC	2	6	152565	152570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494810
2503	NC_014002	TAT	2	6	152696	152701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494810
2504	NC_014002	GT	3	6	152843	152848	0 %	50 %	50 %	0 %	294494810
2505	NC_014002	TAA	2	6	152900	152905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494810
2506	NC_014002	CTG	2	6	152927	152932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494810
2507	NC_014002	GTAG	2	8	152939	152946	25 %	25 %	50 %	0 %	294494810
2508	NC_014002	TTC	2	6	153199	153204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494811
2509	NC_014002	GGT	2	6	153282	153287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494811
2510	NC_014002	CT	3	6	153403	153408	0 %	50 %	0 %	50 %	294494811
2511	NC_014002	TAT	2	6	153489	153494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494811
2512	NC_014002	CTG	2	6	153501	153506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494811
2513	NC_014002	TTG	2	6	153589	153594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494811
2514	NC_014002	ATT	2	6	153627	153632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494811
2515	NC_014002	ATC	2	6	153643	153648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494811
2516	NC_014002	GTT	2	6	153675	153680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494811
2517	NC_014002	GAA	2	6	153714	153719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494811
2518	NC_014002	TCC	2	6	153787	153792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494811
2519	NC_014002	CTT	2	6	153800	153805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494811
2520	NC_014002	TTC	2	6	153843	153848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494811
2521	NC_014002	CAT	2	6	153884	153889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494811
2522	NC_014002	TGG	2	6	153986	153991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494811
2523	NC_014002	TC	3	6	154046	154051	0 %	50 %	0 %	50 %	294494811
2524	NC_014002	TAC	2	6	154062	154067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494811
2525	NC_014002	AAC	2	6	154078	154083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494811
2526	NC_014002	CTA	3	9	154091	154099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494811
2527	NC_014002	CT	3	6	154104	154109	0 %	50 %	0 %	50 %	294494811
2528	NC_014002	AGC	2	6	154112	154117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494811
2529	NC_014002	CGG	2	6	154124	154129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494811
2530	NC_014002	CTG	2	6	154137	154142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494811
2531	NC_014002	GGC	3	9	154209	154217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494811
2532	NC_014002	CTT	2	6	154313	154318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494811
2533	NC_014002	TCG	2	6	154352	154357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494811
2534	NC_014002	CAA	2	6	154358	154363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494811
2535	NC_014002	ATC	2	6	154401	154406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494811
2536	NC_014002	TGC	2	6	154414	154419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494811
2537	NC_014002	CTA	3	9	154436	154444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494811
2538	NC_014002	AT	3	6	154472	154477	50 %	50 %	0 %	0 %	294494811
2539	NC_014002	TGG	2	6	154600	154605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494811
2540	NC_014002	GCA	2	6	154643	154648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494811
2541	NC_014002	AGG	2	6	154661	154666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494811
2542	NC_014002	AATAC	2	10	154705	154714	60 %	20 %	0 %	20 %	294494811
2543	NC_014002	ATT	2	6	154732	154737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494811
2544	NC_014002	GCC	2	6	154754	154759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494811
2545	NC_014002	TGG	2	6	154809	154814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494811
2546	NC_014002	CAG	2	6	154872	154877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494811
2547	NC_014002	CTT	2	6	154934	154939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494811
2548	NC_014002	CCT	2	6	154945	154950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494811
2549	NC_014002	CAG	2	6	154966	154971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494811
2550	NC_014002	ACCA	2	8	155109	155116	50 %	0 %	0 %	50 %	294494811
2551	NC_014002	CA	3	6	155195	155200	50 %	0 %	0 %	50 %	294494811
2552	NC_014002	CCA	2	6	155338	155343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494811
2553	NC_014002	ACC	2	6	155400	155405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494811
2554	NC_014002	CCA	2	6	155431	155436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494811
2555	NC_014002	TGG	2	6	155594	155599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494811
2556	NC_014002	ATA	2	6	155718	155723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494812
2557	NC_014002	CT	3	6	155794	155799	0 %	50 %	0 %	50 %	294494812
2558	NC_014002	G	6	6	155823	155828	0 %	0 %	100 %	0 %	294494812
2559	NC_014002	CAG	2	6	155839	155844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494812
2560	NC_014002	GAA	2	6	156012	156017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494812
2561	NC_014002	A	6	6	156205	156210	100 %	0 %	0 %	0 %	294494813
2562	NC_014002	TCC	2	6	156266	156271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494813
2563	NC_014002	AACAC	2	10	156497	156506	60 %	0 %	0 %	40 %	294494814
2564	NC_014002	TAAA	2	8	156513	156520	75 %	25 %	0 %	0 %	294494814
2565	NC_014002	ATA	2	6	156590	156595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494814
2566	NC_014002	ATA	2	6	156639	156644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494814
2567	NC_014002	GAA	2	6	156671	156676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494814
2568	NC_014002	ATA	2	6	156726	156731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494814
2569	NC_014002	ACC	2	6	157176	157181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494815
2570	NC_014002	CAT	2	6	157256	157261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494815
2571	NC_014002	CGG	2	6	157265	157270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494815
2572	NC_014002	CAA	2	6	157271	157276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494815
2573	NC_014002	CTC	2	6	157289	157294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494815
2574	NC_014002	AG	3	6	157296	157301	50 %	0 %	50 %	0 %	294494815
2575	NC_014002	TG	3	6	157338	157343	0 %	50 %	50 %	0 %	294494815
2576	NC_014002	T	7	7	157366	157372	0 %	100 %	0 %	0 %	294494815
2577	NC_014002	TGA	2	6	157433	157438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494815
2578	NC_014002	GGCA	2	8	157475	157482	25 %	0 %	50 %	25 %	294494815
2579	NC_014002	CAG	2	6	157497	157502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494815
2580	NC_014002	CGG	2	6	157535	157540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494815
2581	NC_014002	A	6	6	157557	157562	100 %	0 %	0 %	0 %	294494815
2582	NC_014002	CAA	2	6	157563	157568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494815
2583	NC_014002	ATCC	2	8	157622	157629	25 %	25 %	0 %	50 %	294494816
2584	NC_014002	CTG	2	6	157763	157768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494816
2585	NC_014002	A	6	6	157813	157818	100 %	0 %	0 %	0 %	294494816
2586	NC_014002	CTCC	2	8	157822	157829	0 %	25 %	0 %	75 %	294494816
2587	NC_014002	GCA	2	6	157844	157849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494816
2588	NC_014002	CGAT	2	8	158055	158062	25 %	25 %	25 %	25 %	294494816
2589	NC_014002	CT	4	8	158188	158195	0 %	50 %	0 %	50 %	294494816
2590	NC_014002	GCT	2	6	158289	158294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494816
2591	NC_014002	G	6	6	158355	158360	0 %	0 %	100 %	0 %	294494816
2592	NC_014002	CTG	2	6	158361	158366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494816
2593	NC_014002	AAGG	2	8	158410	158417	50 %	0 %	50 %	0 %	294494816
2594	NC_014002	CTG	2	6	158474	158479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494817
2595	NC_014002	AAT	2	6	158517	158522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494817
2596	NC_014002	TGC	2	6	158660	158665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494817
2597	NC_014002	TGG	2	6	158765	158770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494817
2598	NC_014002	TGC	2	6	158892	158897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494817
2599	NC_014002	ATC	2	6	158909	158914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494817
2600	NC_014002	TGG	2	6	159017	159022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494817
2601	NC_014002	ATG	2	6	159062	159067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494817
2602	NC_014002	GTG	2	6	159070	159075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494817
2603	NC_014002	GGGCG	2	10	159111	159120	0 %	0 %	80 %	20 %	294494817
2604	NC_014002	TGC	2	6	159140	159145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494817
2605	NC_014002	T	7	7	159174	159180	0 %	100 %	0 %	0 %	294494817
2606	NC_014002	TGC	2	6	159260	159265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494817
2607	NC_014002	CTG	2	6	159344	159349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494817
2608	NC_014002	ACA	2	6	159367	159372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494817
2609	NC_014002	T	6	6	159835	159840	0 %	100 %	0 %	0 %	294494818
2610	NC_014002	CCAT	2	8	159879	159886	25 %	25 %	0 %	50 %	294494818
2611	NC_014002	TC	3	6	159908	159913	0 %	50 %	0 %	50 %	294494818
2612	NC_014002	TTTCA	2	10	159959	159968	20 %	60 %	0 %	20 %	294494818
2613	NC_014002	AGC	2	6	159987	159992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494818
2614	NC_014002	TCA	2	6	160003	160008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494818
2615	NC_014002	CAT	2	6	160024	160029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494818
2616	NC_014002	TGT	2	6	160034	160039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494818
2617	NC_014002	GGA	2	6	160175	160180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494818
2618	NC_014002	GGT	2	6	160212	160217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494818
2619	NC_014002	GAG	2	6	160250	160255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494818
2620	NC_014002	GGCG	2	8	160342	160349	0 %	0 %	75 %	25 %	294494818
2621	NC_014002	CT	3	6	160428	160433	0 %	50 %	0 %	50 %	294494818
2622	NC_014002	TAC	2	6	160475	160480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494818
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2863	NC_014002	TTA	2	6	172813	172818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494831
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2868	NC_014002	CTT	2	6	172925	172930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494831
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2989	NC_014002	A	7	7	181066	181072	100 %	0 %	0 %	0 %	294494838
2990	NC_014002	TTAT	2	8	181073	181080	25 %	75 %	0 %	0 %	294494839
2991	NC_014002	TGA	2	6	181094	181099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494839
2992	NC_014002	CTG	2	6	181124	181129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494839
2993	NC_014002	CAATA	2	10	181152	181161	60 %	20 %	0 %	20 %	294494839
2994	NC_014002	TCC	2	6	181311	181316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494839
2995	NC_014002	AAATG	2	10	181335	181344	60 %	20 %	20 %	0 %	294494839
2996	NC_014002	CTC	2	6	181395	181400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494839
2997	NC_014002	GT	3	6	181433	181438	0 %	50 %	50 %	0 %	294494839
2998	NC_014002	ATA	2	6	181505	181510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494839
2999	NC_014002	ATT	2	6	181526	181531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494839
3000	NC_014002	CAA	2	6	181584	181589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494839

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